李鸿章得理不饶人，在解释自己为何杀死苏州太平天国投降将领的奏折《骈诛八降酋片》中，又提到了这桩翁家的丑事，“若养虎遗患，苗沛霖、宋景诗皆其前鉴”，仍然以翁同书的做法作为反面教材。
父死兄徙这笔账，翁同龢当然要算到李鸿章头上。
9月16日，平壤失守。第二天一大早，翁同龢上书弹劾李鸿章贻误战机，促使光绪帝颁谕“著拔去李鸿章三眼花翎，褫去黄马褂”。一天之后黄海海战爆发，翁同龢预感“鸭绿江一线可危，即渤海亦可危”，于是建议“宜调东三省兵，而急设大粮台，派大员经理，又于鸭绿江岸筑土炮台等数事”，力主拉长战线，继续战斗。10月24日，日军第二军在花园口登陆，次日日军第一军强渡鸭绿江，接连攻陷九连城、安东（今丹东）、凤凰城等地。31日，翁同龢拜见光绪帝时，即“力陈京师阽危情形，请勿再迟一刻”。光绪见他对军事如此忧心如焚，11月3日颁发明旨，补授其担任军机大臣一职。
