太后对皇帝的要求非常严格，从不溺爱放纵。她深知教子就是治国，如果皇帝教导不好，其后果将是难以想象的。皇帝虽然年幼，但已是一国之主，如果不从小造就，将来怎能去治理天下？
皇帝还是小孩心性，比较贪玩，不愿意读书，有时使起性子来，谁也无法加以管束。太后得知后，常把神宗召到面前，严厉训斥，还罚他跪在地上反省，一跪就是几个时辰。周围的大臣都觉得有些太严厉了，但太后并不因此而放松对他的管束。为了检查皇帝的读书效果，太后不厌其烦，让他一遍遍地背书，并令他学着讲臣的样子，当着自己的面宣讲，直到满意为止。遇到早朝的时候，太后就半夜就起身，到了五更时分，便亲自走到皇帝的寝所，大声呼唤：“皇儿快起！皇儿快起！”不叫醒就不罢休。然后让左右的人拉着皇帝坐起来，取水洗脸，等皇帝完全清醒过来，才搀着他登辇而出，一直送到大殿。这样不管寒暑，几年如一日，使神宗养成了不贪睡的习惯。
太后不仅自己严加管束，还要诸位内臣也效法她的样子来教育和管束皇帝。她说，对皇帝该说就说，该管就管，这并不是犯上之举。她常对内臣说：“皇上尚年幼，需要各位勤加服侍，才不辜负了先帝的一片厚爱。但服侍而不教诲，又怎能算恪尽职守呢？又怎么算是尽职尽责的臣子呢？你们只要忠心对皇上，就算有些得罪的地方，将来皇上也不会怪罪你们的，等他长大明白了事理，自然会感激你们，觉得各位是有功德的。”因此，内臣们也打消了顾虑，放手去管教了。有时即使有过分的地方，太后也毫不介意，还要开导皇帝明辨是非，有容人之雅量。长此以往，神宗事太后逾发恭谨，对大臣提出的好的建议十分听从了。